L'équipe féminine joue le plus souvent sur le terrain n°10 de la Plaine des Jeux de Gerland, à 400 mètres du stade de l'équipe masculineLa section féminine est créée durant les années 1970 au sein du club masculin du « FC Lyon ». Cette section est rattachée à l'Olympique lyonnais lors de l'été 2004.
En 2007, pour la première fois l'équipe championne de L1 masculine est la même que l'équipe victorieuse de Division 1 féminine. Le club réalise ainsi un doublé filles-garçons inédit.
En 2008, le club se révéle sur le plan européen en atteignant la demi-finale de la Coupe UEFA féminine, après avoir notamment éliminé le club anglais d'Arsenal.
Lors de la saison 2007-2008, l'équipe termine invaincue, et ce toutes compétitions confondues malgré l'élimination en Coupe UEFA féminine contre Umeå IK (1-1 au match aller et 0-0 au match retour). Cette saison voit également l'équipe réaliser son premier doublé Coupe/championnat, soit exactement la même chose que chez les hommes.
